Mno, než bych provedl nějaký benchmark disku, tak bych si asi nejdřív zjistil jestli jej nemám příliš fragmentovaný
Takže, udělej defragmentaci obou disků. Ale až po...
1) Pozor na to jak je nastavený tzv. "odkládací soubor" na disku/discích. Win si jej standardně nastavují po svém, tj. na hodnotu od min do max. Základ je nastavit si jej pevně na 1,5-2násobek RAM.
2) Optimalizuj i velikost "Koše" (pravé tl. myši na ikoně > vlastnosti > nastav hodnotu tak na 1% velikosti disku).
3) Pak je tu ještě onen slavný "bod obnovení", který bývá také nastaven na dost velké % hodnoty pevného disku (já osobně tuhle "fičuru" úplně vypínám).
4) Poslední co bych před měřením udělal je: fyzické odpojení se od netu, vypnutí všech programů (i těch co mohou běžet v pozadí a nutně nepotřebuji - antivir, různé pomůcky).
Proč to všechno? Protože tu rychlost může ovlivnit i to, že "něco" současně s testovací aplikací na ten disk přistupuje
Pak se taky nespoléhej jen na jeden program, ale porovnej s výsledky i dalších podobný aplikací.